- 担当教員
- 秋山 泰
- 使用教室
- 月5-6(W833)
- 単位数
- 講義：2 演習：0 実験：0
- 講義コード
- 76043
- シラバス更新日
- 2012年5月13日
- 講義資料更新日
- 2012年5月13日
- 学期
- 前期
講義概要
生命を情報システムとして据えるバイオインフォマティクスの分野を概観する。膨大で多様なデータから意味を抽出するために，様々な数理的技法が融合的に応用される様子を紹介し，情報工学の社会的な応用の実例を学ぶ。
講義の目的
生命のメカニズムを情報論的に捉えるバイオインフォマティクスは，複雑な生
命体を理解し制御するための新しい学問として注目されるだけでなく，膨大で
多様なデータから意味を抽出するために様々な最新の数理的手法の応用が試さ
れる興味深い現場でもある．当講義では，生命を情報システムとして捉える新
しい学問分野について概観しながら，様々な数理的技法が融合的に応用される
様子を紹介し，情報工学の社会的な応用の実例を学ぶ．
講義計画
1. Introduction
2. Sequence Alignment
3. Multiple Alignment
4. Phylogenetic Tree
5. Homology Search from Databases
6. Fast Algorithms for Homology Search
7. Sequence Motifs
8. HMM, Motif DBs
9. Genome-wide Comparison
10. Transcriptome Analysis
11. RNA Secondary Structure Prediction
12. Protein Structures
13. Molecular Simulation
14. Protein Structure Prediction
教科書・参考書等
資料配布
参考書等
バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム，阿久津達也著，共
立出版, 2007. 生物配列の統計，岸野洋久・浅井 潔著，共立出版, 2003.
関連科目・履修の条件等
←確率と統計（学部），情報認識 （学部），生命情報解析（学部），パターン情報処理，機械学習
成績評価
期末試験および小課題により評価する．
担当教員の一言
特になし
